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https://hdl.handle.net/20.500.14094/90007814
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90007814 (fulltext)
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3.01 MB
17
メタデータ
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メタデータID
90007814
アクセス権
open access
出版タイプ
Version of Record
タイトル
Exchange of endogenous and heterogeneous yeast terminators in Pichia pastoris to tune mRNA stability and gene expression
著者
Ito, Yoichiro ; Terai, Goro ; Ishigami, Misa ; Hashiba, Noriko ; Nakamura, Yasuyuki ; Bamba, Takahiro ; Kumokita, Ryota ; Hasunuma, Tomohisa ; Asai, Kiyoshi ; Ishii, Jun ; Kondo, Akihiko
著者ID
A0995
研究者ID
1000050379153
KUID
https://kuid-rm-web.ofc.kobe-u.ac.jp/search/detail?systemId=bce907436da823f1520e17560c007669
著者名
Ito, Yoichiro
伊藤, 洋一郎
イトウ, ヨウイチロウ
所属機関名
科学技術イノベーション研究科
著者名
Terai, Goro
著者名
Ishigami, Misa
著者名
Hashiba, Noriko
著者ID
A0226
研究者ID
1000040733184
KUID
https://kuid-rm-web.ofc.kobe-u.ac.jp/search/detail?systemId=0f47c7fa7e5dcad5520e17560c007669
著者名
Nakamura, Yasuyuki
中村, 泰之
ナカムラ, ヤスユキ
所属機関名
科学技術イノベーション研究科
著者名
Bamba, Takahiro
著者名
Kumokita, Ryota
著者ID
A0960
研究者ID
1000020529606
KUID
https://kuid-rm-web.ofc.kobe-u.ac.jp/search/detail?systemId=73b63639d47d0a4b520e17560c007669
著者名
Hasunuma, Tomohisa
蓮沼, 誠久
ハスヌマ, トモヒサ
所属機関名
先端バイオ工学研究センター
著者名
Asai, Kiyoshi
著者ID
A1290
研究者ID
1000040512546
KUID
https://kuid-rm-web.ofc.kobe-u.ac.jp/search/detail?systemId=c06bf6c66d97f49e520e17560c007669
著者名
Ishii, Jun
石井, 純
イシイ, ジュン
所属機関名
先端バイオ工学研究センター
著者ID
A1715
研究者ID
1000040205547
KUID
https://kuid-rm-web.ofc.kobe-u.ac.jp/search/detail?systemId=a324eb4a1b052e53520e17560c007669
著者名
Kondo, Akihiko
近藤, 昭彦
コンドウ, アキヒコ
所属機関名
科学技術イノベーション研究科
収録物名
Nucleic Acids Research
巻(号)
48(22)
ページ
13000-13012
出版者
Oxford University Press (OUP)
刊行日
2020-12-16
公開日
2021-02-03
抄録
In the yeast Saccharomyces cerevisiae, terminator sequences not only terminate transcription but also affect expression levels of the protein-encoded upstream of the terminator. The non-conventional yeast Pichia pastoris (syn. Komagataella phaffii) has frequently been used as a platform for metabolic engineering but knowledge regarding P. pastoris terminators is limited. To explore terminator sequences available to tune protein expression levels in P. pastoris, we created a 'terminator catalog' by testing 72 sequences, including terminators from S. cerevisiae or P. pastoris and synthetic terminators. Altogether, we found that the terminators have a tunable range of 17-fold. We also found that S. cerevisiae terminator sequences maintain function when transferred to P. pastoris. Successful tuning of protein expression levels was shown not only for the reporter gene used to define the catalog but also using betaxanthin production as an example application in pathway flux regulation. Moreover, we found experimental evidence that protein expression levels result from mRNA abundance and in silico evidence that levels reflect the stability of mRNA 3'-UTR secondary structure. In combination with promoter selection, the novel terminator catalog constitutes a basic toolbox for tuning protein expression levels in metabolic engineering and synthetic biology in P. pastoris.
カテゴリ
科学技術イノベーション研究科
先端バイオ工学研究センター
学術雑誌論文
権利
© The Author(s) 2020. Published by Oxford University Press on behalf of Nucleic Acids Research.
This is an Open Access article distributed under the terms of the Creative Commons Attribution-Non-Commercial License(http://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/), which permits non-commercial re-use, distribution, and reproduction in any medium, provided the original work is properly cited. For commercial re-use, please contact journals.permissions@oup.com
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資源タイプ
journal article
言語
English (英語)
ISSN
0305-1048
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eISSN
1362-4962
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NCID
AA00760269
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DOI
https://doi.org/10.1093/nar/gkaa1066
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